Utilisation du transcriptome pour préciser la localisation d'un QTL responsable de la variabilité d'engraissement chez le poulet de chair

Guillaume Le Mignon (1, 2) , Frederique Pitel (3) , Colette Désert (4) , Sophie Leroux (3) , Olivier Demeure (1) , Grégory Guernec (5) , Madeleine Douaire (4) , Pascale Le Roy (4) , Sandrine Lagarrigue (1)

1 GARen - Génétique Animale
2 ITAVI
3 LGC - Laboratoire de Génétique Cellulaire
4 GenHort - Génétique et Horticulture
5 SCRIBE - Station commune de Recherches en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement

Alors que de nombreux QTL pour différents caractères ont été cartographiés dans les espèces d'élevage, l'identification des mutations causales reste encore laborieuse. Nous proposons dans cette étude de combiner analyse de liaison et données transcriptomiques pour cartographier plus finement une région QTL de l'engraissement chez le poulet de chair préalablement détecté sur le chromosome 5. Trois stratégies ont été utilisées. Ces trois stratégies permettent d'affiner l'intervalle de localisation de ce QTL initialement de 160-191 cM (7Mb) à 182-185 cM (0,6Mb) en accord avec l'intervalle de localisation de 165-184 cM préalablement détecté dans un dispositif F2 de plus de 1200 individus. Le nombre de gènes candidats localisés dans cet intervalle est maintenant réduit de 118 à 19 gènes. Nos résultats démontrent la faisabilité et l'intérêt de la stratégie de génomique génétique chez les animaux d'élevage.

Mots clés: POULET; ADIPOSITE; TRANSCRIPTOME; CHICKENS; ADIPOSITY; TRANSCRIPTOMICS; QTL

Domaines: Génétique animale

Guillaume Le Mignon, Frederique Pitel, Colette Désert, Sophie Leroux, Olivier Demeure, et al.. Utilisation du transcriptome pour préciser la localisation d'un QTL responsable de la variabilité d'engraissement chez le poulet de chair. Huitièmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Paris (FR), France. ⟨hal-00730108⟩